土壤中有机物质的分解和腐殖化，在土壤这个“生物社会”中，于各种类型的生种间错综复杂的食物链中进行着，在这一过程中，除微生物外，土壤动物也是土壤有机物质分解和腐殖化的重要参与者。而在土壤动物中，又需首推蚯蚓的作用。
大量的试验结果表明，蚯蚓的摄食植物残体，笑话、排泄粪便和打洞等生命活动。耕烦了土地，增加了土壤的孔隙，在蚯蚓粪便及其栖息地域的周围富积了营养分，从而改善了土壤的理化性扶，提高了土壤肥力。

蚯蚓分解土壤有机质的作用，主要依靠存在于蚯蚓消化道中的纤维素酶和几丁质酶等的活性。这些酶是由蚯蚓本身分泌的，而不是某些节肢动物是由共生的微生物所分泌。蚯蚓肠道中虽然也有微生物存在，有时数量还商于周围的土壤。但蚯蚓肠道中似乎并没有一套固有的肠道微生物区系。有些徽生物在体内还受到肠道分泌物的阻碍，抑制，有些甚至被杀死。但是，蚯蚓粪中却有大量微生物存在。蚯蚓粪中微生物区系群体的大小，一般决定于其中所含消化了的植物物质的类型和数量。土壤中的蚯蚓，不仅能通过自身摄食、粉碎和搬运等来帮助土壤有机物质的分解，而且蚯蚓活动时所产生的废物，还能刺激微坐物的分解过程。

在土壤动物中，还有一大类群原生动物，对土壤肥力的维持也具有一定的作用，例如当固氮菌（Azotobacter）与原生动物中的豆形虫(Colpidium)共存时，固氮能力比其单独存在时为高。再如细菌与变形虫共存时，细菌对糖的氧化能力有所增加。有些微生动物如鞭毛虫之中有的靠吸收土壤中的有机质进行腐生性的养分摄取。但由于原生动物在土壤中存在的数量较细菌、放线菌等要少得多，因此，参与土壤,有机物质的分解和腐殖质化过挫中，相对的说其作用较小。

其他如熊田恭一研究过的昆虫鼠妇（Armadillium Vulgare)和独角仙(Trypoxylus dichotoma)等都有一定的分解有机质和腐殖质化效应。